A مطالعه اخیر شناسایی می کند la کروناویروس جدید مسئول اپیدمی پنومونی در استان هوبی چین است- ویروس منشأ خفاش با سایر ویروس‌های ویروسی بیماری‌زای شناخته شده مرتبط است
La 2019 کروناویروس جدید (CoV) باعث ذات الریه کشنده می شود که بیش از 1300 قربانی گرفته است و بیش از 52000 مورد تایید شده عفونت توسط 13 فوریه 2020، همه در بازه زمانی کمی بیش از یک ماه. اما، این ویروس چیست؟ آیا کلا ویروس جدیدی است؟ از کجا آمده؟ دانشمندان موسسات تحقیقاتی برتر در چین برای پاسخ به این سوالات با هم همکاری کردند و این مطالعه پیشگامانه در مجله پزشکی چین.
https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs
در اوایل دسامبر، چند نفر در شهر ووهان در استان هوبی چین پس از رفتن به بازار غذاهای دریایی محلی مریض شدند. آنها علائمی مانند سرفه، تب و تنگی نفس و حتی عوارض مربوط به سندرم دیسترس تنفسی حاد (ARDS) را تجربه کردند. تشخیص فوری ذات الریه بود، اما علت دقیق آن نامشخص بود. چه چیزی باعث این شیوع جدید شد؟ آیا این سندرم حاد تنفسی (SARS)-CoV است؟ آیا این سندرم تنفسی خاورمیانه (MERS)-CoV است؟ همانطور که مشخص است، دانشمندان پس از تجزیه و تحلیل چند مورد اول، مطالعه ای را برای شناسایی این ویروس در ماه دسامبر انجام داده بودند. این مطالعه اکنون در منتشر شده است مجله پزشکی چین و هویت ویروس مشخص شده است - این یک ویروس کاملاً جدید است که ارتباط نزدیکی با CoV مشابه خفاش SARS دارد. دکتر Jianwei Wang (آکادمی علوم پزشکی چین، موسسه زیست شناسی پاتوژن)، محقق ارشد این مطالعه، بیان می کند:مقاله ما هویت CoV با منشاء خفاش را مشخص کرده است که تاکنون ناشناخته بود."
در این مطالعه، دانشمندان مؤسسه‌های تحقیقاتی مشهور در چین، مانند آکادمی علوم پزشکی چین، مؤسسه زیست‌شناسی پاتوژن، بیمارستان دوستی چین و ژاپن، و کالج پزشکی اتحادیه پکن، مشترکاً کووید-۱۹ جدید را کشف و شناسایی کردند. شیوع ووهان - با توالی یابی نسل بعدی (NGS). آنها روی پنج بیمار بستری شده در بیمارستان جین یین تان در ووهان تمرکز کردند که بیشتر آنها کارگران بازار غذاهای دریایی Huanan در ووهان بودند. این بیماران تب بالا، سرفه و علائم دیگر داشتند و در ابتدا تشخیص داده شد که به ذات الریه مبتلا هستند، اما علت نامشخصی دارد. وضعیت برخی از بیماران به سرعت به ARDS بدتر شد. حتی یکی مرد دکتر وانگ می گوید:عکسبرداری با اشعه ایکس از قفسه سینه بیماران مقداری کدورت و تثبیت مه آلود را نشان داد که نمونه ای از ذات الریه است. با این حال، ما می خواستیم بفهمیم که چه چیزی باعث ذات الریه شده است و آزمایشات بعدی ما علت دقیق آن را نشان داد.- یک CoV جدید که قبلاً شناخته شده نبود."
برای این مطالعه، دانشمندان از نمونه‌های مایع برونکوآلوئولار (BAL) استفاده کردند (BAL روشی است که در آن مایع استریل از طریق برونکوسکوپ به ریه‌ها منتقل می‌شود و سپس برای تجزیه و تحلیل جمع‌آوری می‌شود).
ابتدا، دانشمندان تلاش کردند تا ویروس را با توالی ژنوم و با استفاده از فناوری NGS شناسایی کنند. NGS روش غربالگری ترجیحی برای شناسایی پاتوژن‌های ناشناخته است، زیرا به سرعت همه میکروارگانیسم‌های بیماری‌زای شناخته شده در نمونه را شناسایی و رد می‌کند. بر اساس توالی‌یابی DNA/RNA از نمونه‌های مایع BAL، دانشمندان دریافتند که اکثر قرائت‌های ویروسی به خانواده CoV تعلق دارند. سپس دانشمندان «خوانده‌های» متفاوتی را که به CoVs تعلق داشت جمع‌آوری کردند و یک توالی ژنومی کامل برای ویروس جدید ساختند. این توالی‌ها در بین نمونه‌های بیماران 99.8/99.9-90/79.0 درصد مشابه بودند که نشان می‌دهد این ویروس عامل بیماری‌زای رایج در همه بیماران است. علاوه بر این، با استفاده از تجزیه و تحلیل همسانی، که در آن یک توالی ژنوم با سایر توالی های ژنوم شناخته شده مقایسه می شود (با آستانه از پیش تعیین شده 51.8٪ برای در نظر گرفتن توالی "جدید")، آنها تأیید کردند که توالی ژنوم این ویروس جدید 87.6٪ است. مشابه SARS-CoV، حدود 87.7٪ شبیه به MERS-CoV، و حدود 45-21٪ مشابه سایر CoVهای SARS مانند از خفاش های نعل اسبی چینی (به نام ZCXNUMX و ZXCXNUMX). تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که توالی‌های پنج سویه CoV به‌دست‌آمده نزدیک‌ترین توالی به سویه‌های مشتق شده از خفاش بودند، اما شاخه‌های تکاملی جداگانه‌ای را تشکیل دادند. این یافته ها به وضوح نشان می دهد که ویروس از خفاش ها منشا گرفته است. دکتر وانگ می گوید:از آنجا که شباهت‌های ژن replicase ویروسی با سایر ویروس‌های "مشابه" شناخته شده هنوز کمتر از 90٪ است و همچنین با در نظر گرفتن نتایج تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، ما در نظر می‌گیریم که این در واقع یک CoV جدید و قبلا ناشناخته است. این ویروس جدید به طور موقت 2019 نامیده می شود-ncov."
در نهایت، دانشمندان با بررسی اینکه آیا نمونه‌های مایع اثر سیتوپاتیک روی رده‌های سلولی در آزمایشگاه نشان می‌دهند یا خیر، اقدام به جداسازی ویروس از نمونه‌های مایع BAL کردند. سلول‌هایی که در معرض نمونه‌های مایع قرار گرفتند، زیر میکروسکوپ الکترونی مشاهده شدند و دانشمندان ساختارهای مشخصه‌ای شبیه کووید را پیدا کردند. آنها همچنین از ایمونوفلورسانس استفاده کردند - تکنیکی که از آنتی بادی های خاصی که با رنگ های فلورسنت برچسب گذاری شده اند استفاده می کند. برای این کار از سرم بیماران در حال بهبودی (که حاوی آنتی بادی بود) استفاده کردند که با ذرات ویروسی داخل سلول ها واکنش نشان می داد. این تایید کرد که این ویروس واقعاً عامل عفونت بوده است.
این مطالعه راه را برای مطالعات آینده برای درک بهتر ویروس و منابع آن هموار می کند، به ویژه با توجه به گسترش سریع آن، توانایی آن در ایجاد ARDS کشنده و وحشت ناشی از شیوع. اگرچه 4 نفر از 5 بیمار که این ویروس از آنها شناسایی شد از یک بازار غذاهای دریایی در ووهان بودند، منشاء دقیق عفونت ناشناخته است. CoV می‌تواند از طریق یک ناقل «واسطه» به انسان منتقل شده باشد، مانند SARS-CoV (گوشت نخل) یا MERS-CoV (شتر). دکتر وانگ نتیجه گیری می کند:همه کوویدهای انسانی انسان و دام هستند و چندین کووید انسانی از خفاش‌ها منشاء گرفته‌اند، از جمله ویروس‌های SARS و MERS-CoV. مطالعه ما به وضوح نیاز فوری به نظارت منظم بر انتقال CoVs منشاء خفاش به انسان را نشان می دهد. ظهور این ویروس یک تهدید بزرگ برای سلامت عمومی است و بنابراین، درک منبع این ویروس و تصمیم گیری در مورد مراحل بعدی قبل از اینکه شاهد شیوع گسترده‌تر باشیم، اهمیت حیاتی دارد."
چه چیزی را از این مقاله باید حذف کرد:
- برای این مطالعه، دانشمندان از نمونه‌های مایع برونکوآلوئولار (BAL) استفاده کردند (BAL روشی است که در آن مایع استریل از طریق برونکوسکوپ به ریه‌ها منتقل می‌شود و سپس برای تجزیه و تحلیل جمع‌آوری می‌شود).
- Further, using homology analysis, where a genome sequence is compared against other known genome sequences (with a preset threshold of 90% for it to be considered a “new” sequence), they confirmed that the genome sequence of this new virus is 79.
- This study is now published in Chinese Medical Journal and the identity of the virus has been established—it is a completely new virus, closely related to the bat SARS-like CoV.
